ओपन सर्जरी की तुलना में एनल फिस्टुला का लेजर उपचार के बाद रिकवरी के दौरान अधिक दर्द नहीं होता है। हालांकि आपको सर्जरी के बाद सर्जिकल क्षेत्र में थोड़ा दर्द या असुविधा हो सकती है, इसलिए आपका चिकित्सक आपके बेचैनी को कम करने के लिए आमतौर पर उपयोग की जाने जाने वाली लिडोकाइन जैसी लोकल एनेस्थीसिया इंजेक्ट करेगा और कुछ दर्द निवारक दवाइयाँ लिख देगा। यदि रिकवरी के दौरान दर्द होता है तो आप उन दर्द निवारक दवाइयों का सेवन कर सकते हैं।

कई बार एनल फिस्टुला होने का कारण गुदा क्षेत्र में कोई पुराना इन्फेक्शन या पिम्पल होता है। इन्फेक्शन का उपचार नहीं होने पर वह एनल फिस्टुला में परिवर्तित हो जाता है और उसमें पस एवं रक्त भर जाता है। इसलिए, गुदा क्षेत्र के इन्फेक्शन या पिम्पल को हल्के में नहीं लेना चाहिए, बल्कि इसकी जाँच करवा के उचित इलाज करना चाहिए।

एनल फिस्टुला की सर्जरी के बाद फास्ट रिकवरी के लिए,अनेक प्रकार के तरल पदार्थों सहित पानी भरपूर मात्रा में पिएं। कब्ज को प्रेरित करने वाले आहार से परहेज करें। फाइबर का सेवन करें इससे कब्ज नहीं होगा और रिकवरी में आसानी होगी। जंक फूड, तैलीय एवं मिर्च मसाले युक्त खाद्य पदार्थों का बिल्कुल भी सेवन न करें। इससे अपच होगा और फिस्टुला की रिकवरी में जटिलताएं होंगी।

कुछ ऐसे घरेलू उपचार हैं जिनसे आप एनल फिस्टुला को ठीक करने की कोशिश कर सकते हैं लेकिन ये उपाय केवल स्थिति को अस्थायी रूप से ठीक करते हैं और दर्द से अस्थाई रूप से आराम दिलाते है।

कुछ घरेलू उपचार, जैसे- सिट्ज़ बाथ, एनल क्षेत्र में पैड पहनना, फाइबर का सेवन करना और खूब पानी पीना आदि शामिल हैं।

सर्जरी के बाद 1 दिन में रोगी को स्वस्थ स्थिति में अस्पताल से छुट्टी दे दी जाती है। अस्पताल से छुट्टी मिलने के बाद मरीज अपनी सामान्य दिनचर्या को फिर से शुरू कर सकता है। लेकिन, रोगी को यह सलाह दी जाती है कि वह लगातार घंटों तक न बैठे और अपनी दिनचर्या में थोड़ी शारीरिक गतिविधियों को शामिल करे। शारीरिक गतिविधियों का मतलब, जिम या एक्सरसाइज नहीं है बल्कि, टहलना घूमना आदि है।

कुछ दवाएं जैसे कि एंटीबायोटिक्स, आयुर्वेदिक हर्बल और होम्योपैथिक संक्रमण को नियंत्रित कर सकते हैं, लेकिन इनसे फिस्टुला को स्थायी रूप से ठीक करने का आश्वासन नहीं दिया जा सकता है।